工程经受严峻考验。

    1999年，施工进入混凝土浇筑高峰期，之后连续3年混凝土年浇筑量突破400万立方米，屡创世界纪录。

    从2000年开始，金属结构和机电设备安装工程伴随混凝土浇筑和灌浆工程相继展开，2001年进入安装高峰。

    2002年1月，三峡二期工程的枢纽工程、输变电工程、移民工程3个验收大纲通过审查。随后，三峡二期工程蓄水前库底清理工作全面启动。

    2002年5月，上游基坑破堰进水。7月，下游基坑破堰进水。三峡大坝从此担负起永久挡水的使命。

    2002年10月26日，随着最后一仓混凝土浇筑到位，全长1580米的三峡左岸大坝全线浇筑到设计的185米高程。20天以后，三峡工程胜利实现了导流明渠截流。

    2003年5月29日，国务院三峡工程建设委员会第十二次全体会议批准国务院长江三峡二期工程验收组的验收意见，同意枢纽工程按期下闸蓄水，船闸进行试通航，首批机组发电。

    2003年6月1日，三峡工程如期下闸蓄水。6月10日，水库蓄水到135米。

    2003年6月16日，双线五级船闸成功试通航。

    2003年7月10日，首台机组并网发电，到11月22日，首批6台机组相继投产发电。三峡工程二期三大目标顺利实现。

    2006年5月20日14时，三峡大坝最后一仓混凝土浇筑完毕，标志着长江三峡水利枢纽主体工程完工，中国已在长江三峡建成世界上最大的水坝。

    按照原定计划，到2009年，长江三峡工程将全部竣工，成为一项具有防洪、发电、航运等巨大综合效益的伟大工程。